É competência da Comissão de Trabalhadores a defesa dos interesses profissionais dos trabalhadores nomeadamente:

• Acompanhar o controlo de gestão da empresa promovendo o empenhamento responsável dos trabalhadores na atividade da empresa, apresentando sugestões, recomendações, ou críticas tendentes á melhoria das condições de trabalho;
• Defender junto dos órgãos de gestão e fiscalização os legítimos interesses dos trabalhadores;
• Participar nos processos de reestruturação;
• Pronunciar-se sobre a reorganização da Instituição ou dos seus serviços;
• Exigir da Instituição o cumprimento e aplicação das normas constitucionais e legais respeitantes aos direitos dos trabalhadores;
• Reunir periodicamente com o Conselho de Administração e demais órgãos de gestão, entre outras ações.